多粘类芽孢杆菌（paenibacillus |
|
|
多粘类芽孢杆菌（paenibacillus polymyxa）sc2fusa基因部分序列的克隆与分析 收藏此文
全部作者 ： 朱辉 丁延芹 田方 姚良同 杜秉海
第一作者单位 ： 山东农业大学生命科学学院
论文摘要 ： 利用检测非核糖体肽合成酶（nrpss）基因保守区的兼并引物tgd和lgg，pcr扩增sc2菌株的nrpss基因保守区序列，获得一段497bp的nrps基因保守区片断。采用热不对称交错pcr（tail-pcr）方法，以sc2菌株基因组dna为模板,根据nrps基因保守区序列，分别向两侧设计特异性引物，扩增该已知序列的两侧序列。随后，进行多次特异性引物设计，进行tail-pcr。同时，根据枯草芽孢杆菌（bacillus subtilis）bamc、mycc、ituc和解淀粉芽孢杆菌（bacillus amyloliquefaciens ）fzb42bmyc的同源序列，设计兼并引物进行pcr扩增。将得到的所有序列进行拼接，得到长度为19040bp的dna序列。该dna序列包含一个5’-末端不完整的17502bp 的orf，编码5833个氨基酸。该orf与p. polymyxa e681的fusa的6214-23727bp序列同源性为90%，其推测的氨基酸序列相似性为92%。对p. polymyxa sc2的fusa的5333个氨基酸的多肽片断进行结构域分析，结果表明，该多肽片断包含四个模块，分别为c-a-t、c-a-t-e、c-a-t-e和c-a-t；四个模块中的a结构域可能识别的特异性氨基酸底物分别为l-tyr、d-thr、d-asn和ala, 与fusaricidin c的后四个氨基酸残基组成和顺序相一致。p. polymyxa sc2的fusa片断的四个a结构域的氨基酸序列与p. polymyxa e681的fusa的a3、a4、a5和a6结构域的相似性分别为86%、94%、98%和96%；其对应的核苷酸序列同源性分别为85%、89%、94%和92%。
关键词 ： 多粘类芽孢杆菌，nrpss, fusa，fusuricidin合成酶基因
发表日期 ： 2008年02月03日
同行评议 ： 1. 讨论中应对本研究中的多粘类芽孢杆菌菌株sc2与已发表的多粘类芽孢杆菌的其他菌株比较，该菌株有何特点或优势，本研究有何新发现？2. 引言第二行“植物病源真菌”应改为“植物病原真菌”。3. 中英文摘要中菌名和基因名没用斜体。 综合评价：
多粘类芽孢杆菌（paenibacillus 来自: 免费论文网www.paper800.com
远程下载:《多粘类芽孢杆菌（paenibacillus》论文(PDF全文)
|
|
|
|
|
|
|
